Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNA4

RNF111, E3 ubiquitin-protein ligase Arkadia, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF111Q6ZNA4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF111Q6ZNA4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF111Q6ZNA4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF111Q6ZNA4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF111Q6ZNA4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF111Q6ZNA4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF111Q6ZNA4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF111Q6ZNA4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF111Q6ZNA4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF111Q6ZNA4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF111Q6ZNA4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF111Q6ZNA4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF111Q6ZNA4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF111Q6ZNA4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF111Q6ZNA4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF111Q6ZNA4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF111Q6ZNA4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF111Q6ZNA4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms