Protein–RNA interactions for Protein: Q6WBX8

RAD9B, Cell cycle checkpoint control protein RAD9B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9BQ6WBX8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD9BQ6WBX8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD9BQ6WBX8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD9BQ6WBX8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD9BQ6WBX8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD9BQ6WBX8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD9BQ6WBX8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD9BQ6WBX8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD9BQ6WBX8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD9BQ6WBX8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD9BQ6WBX8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD9BQ6WBX8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD9BQ6WBX8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD9BQ6WBX8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD9BQ6WBX8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD9BQ6WBX8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD9BQ6WBX8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD9BQ6WBX8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD9BQ6WBX8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD9BQ6WBX8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAD9BQ6WBX8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD9BQ6WBX8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD9BQ6WBX8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD9BQ6WBX8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms