Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD1Q6UWL2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUSD1Q6UWL2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms