Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN5Q6U736 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
OPN5Q6U736 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OPN5Q6U736 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OPN5Q6U736 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OPN5Q6U736 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OPN5Q6U736 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OPN5Q6U736 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OPN5Q6U736 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OPN5Q6U736 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN5Q6U736 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN5Q6U736 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN5Q6U736 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN5Q6U736 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN5Q6U736 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN5Q6U736 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN5Q6U736 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN5Q6U736 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN5Q6U736 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN5Q6U736 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN5Q6U736 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms