Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHC4Q6S5L8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHC4Q6S5L8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHC4Q6S5L8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms