Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCE3

PGM2L1, Glucose 1,6-bisphosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM2L1Q6PCE3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGM2L1Q6PCE3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGM2L1Q6PCE3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms