Protein–RNA interactions for Protein: Q6P499

NIPAL3, NIPA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL3Q6P499 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL3Q6P499 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL3Q6P499 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL3Q6P499 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL3Q6P499 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL3Q6P499 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL3Q6P499 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL3Q6P499 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL3Q6P499 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NIPAL3Q6P499 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NIPAL3Q6P499 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPAL3Q6P499 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL3Q6P499 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms