Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
REEP3Q6NUK4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms