Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN13Q6MZZ7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms