Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDE2Q6IQ49 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDE2Q6IQ49 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms