Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ22

RAB12, Ras-related protein Rab-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12Q6IQ22 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 634 ms