Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM236Q5W0B7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms