Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CARMIL1Q5VZK9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CARMIL1Q5VZK9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CARMIL1Q5VZK9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC39■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CARMIL1Q5VZK9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CARMIL1Q5VZK9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CARMIL1Q5VZK9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CARMIL1Q5VZK9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CARMIL1Q5VZK9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CARMIL1Q5VZK9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
CARMIL1Q5VZK9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CARMIL1Q5VZK9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CARMIL1Q5VZK9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CARMIL1Q5VZK9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CARMIL1Q5VZK9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CARMIL1Q5VZK9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CARMIL1Q5VZK9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CARMIL1Q5VZK9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CARMIL1Q5VZK9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CARMIL1Q5VZK9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CARMIL1Q5VZK9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CARMIL1Q5VZK9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CARMIL1Q5VZK9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CARMIL1Q5VZK9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CARMIL1Q5VZK9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CARMIL1Q5VZK9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CARMIL1Q5VZK9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
CARMIL1Q5VZK9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CARMIL1Q5VZK9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CARMIL1Q5VZK9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CARMIL1Q5VZK9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CARMIL1Q5VZK9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CARMIL1Q5VZK9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
CARMIL1Q5VZK9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CARMIL1Q5VZK9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CARMIL1Q5VZK9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CARMIL1Q5VZK9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CARMIL1Q5VZK9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CARMIL1Q5VZK9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CARMIL1Q5VZK9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
CARMIL1Q5VZK9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
CARMIL1Q5VZK9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CARMIL1Q5VZK9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
CARMIL1Q5VZK9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CARMIL1Q5VZK9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CARMIL1Q5VZK9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
CARMIL1Q5VZK9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
CARMIL1Q5VZK9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms