Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
C1QL3Q5VWW1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QL3Q5VWW1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms