Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ATRNL1Q5VV63 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATRNL1Q5VV63 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms