Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF20Q5VTR2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RNF20Q5VTR2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms