Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHDC7AQ5VTJ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHDC7AQ5VTJ3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHDC7AQ5VTJ3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHDC7AQ5VTJ3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHDC7AQ5VTJ3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLHDC7AQ5VTJ3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms