Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC38Q5VT99 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC38Q5VT99 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC38Q5VT99 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 286.6 ms