Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CROCCQ5TZA2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 288.2 ms