Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
L1TD1Q5T7N2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.56■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.53■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.53■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
L1TD1Q5T7N2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms