Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYCP2LQ5T4T6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYCP2LQ5T4T6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms