Protein–RNA interactions for Protein: Q5T011

SZT2, KICSTOR complex protein SZT2, humanhuman

Predictions only

Length 3,432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZT2Q5T011 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SZT2Q5T011 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SZT2Q5T011 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SZT2Q5T011 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SZT2Q5T011 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SZT2Q5T011 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SZT2Q5T011 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SZT2Q5T011 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SZT2Q5T011 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SZT2Q5T011 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SZT2Q5T011 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SZT2Q5T011 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SZT2Q5T011 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SZT2Q5T011 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SZT2Q5T011 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SZT2Q5T011 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SZT2Q5T011 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SZT2Q5T011 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SZT2Q5T011 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SZT2Q5T011 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SZT2Q5T011 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SZT2Q5T011 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SZT2Q5T011 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SZT2Q5T011 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SZT2Q5T011 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SZT2Q5T011 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SZT2Q5T011 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SZT2Q5T011 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms