Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms