Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCID2Q5JVF3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCID2Q5JVF3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms