Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR44Q5JSH3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR44Q5JSH3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms