Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf38Q5JPI3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms