Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms