Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CDCA8Q53HL2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CDCA8Q53HL2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CDCA8Q53HL2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms