Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL22Q53GT1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms