Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS7

GLE1, Nucleoporin GLE1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLE1Q53GS7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GLE1Q53GS7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLE1Q53GS7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GLE1Q53GS7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GLE1Q53GS7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GLE1Q53GS7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GLE1Q53GS7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GLE1Q53GS7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GLE1Q53GS7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLE1Q53GS7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLE1Q53GS7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLE1Q53GS7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLE1Q53GS7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLE1Q53GS7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms