Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LONRF3Q496Y0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LONRF3Q496Y0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms