Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms