Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP100Q494V2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP100Q494V2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP100Q494V2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP100Q494V2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP100Q494V2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP100Q494V2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP100Q494V2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP100Q494V2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP100Q494V2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP100Q494V2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP100Q494V2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP100Q494V2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP100Q494V2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP100Q494V2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP100Q494V2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP100Q494V2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP100Q494V2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP100Q494V2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
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