Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT71Q3SY84 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT71Q3SY84 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms