Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HFEQ30201 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HFEQ30201 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HFEQ30201 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HFEQ30201 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HFEQ30201 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HFEQ30201 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HFEQ30201 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HFEQ30201 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HFEQ30201 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HFEQ30201 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HFEQ30201 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HFEQ30201 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HFEQ30201 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HFEQ30201 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HFEQ30201 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HFEQ30201 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HFEQ30201 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HFEQ30201 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HFEQ30201 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HFEQ30201 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HFEQ30201 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HFEQ30201 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HFEQ30201 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HFEQ30201 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HFEQ30201 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HFEQ30201 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HFEQ30201 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HFEQ30201 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HFEQ30201 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HFEQ30201 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HFEQ30201 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HFEQ30201 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HFEQ30201 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HFEQ30201 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HFEQ30201 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HFEQ30201 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HFEQ30201 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HFEQ30201 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HFEQ30201 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HFEQ30201 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HFEQ30201 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HFEQ30201 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HFEQ30201 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HFEQ30201 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HFEQ30201 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HFEQ30201 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HFEQ30201 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HFEQ30201 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HFEQ30201 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HFEQ30201 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HFEQ30201 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HFEQ30201 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HFEQ30201 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HFEQ30201 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HFEQ30201 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HFEQ30201 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HFEQ30201 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HFEQ30201 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HFEQ30201 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HFEQ30201 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HFEQ30201 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HFEQ30201 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HFEQ30201 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HFEQ30201 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HFEQ30201 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HFEQ30201 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HFEQ30201 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HFEQ30201 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HFEQ30201 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HFEQ30201 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HFEQ30201 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HFEQ30201 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HFEQ30201 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HFEQ30201 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HFEQ30201 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HFEQ30201 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HFEQ30201 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HFEQ30201 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HFEQ30201 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HFEQ30201 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HFEQ30201 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HFEQ30201 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HFEQ30201 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HFEQ30201 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HFEQ30201 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HFEQ30201 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HFEQ30201 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HFEQ30201 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HFEQ30201 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HFEQ30201 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HFEQ30201 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HFEQ30201 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HFEQ30201 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HFEQ30201 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HFEQ30201 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HFEQ30201 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HFEQ30201 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HFEQ30201 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HFEQ30201 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms