Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC6LQ2NKX8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms