Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q1T7F1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q1T7F1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q1T7F1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q1T7F1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q1T7F1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q1T7F1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q1T7F1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q1T7F1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q1T7F1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q1T7F1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q1T7F1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q1T7F1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q1T7F1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q1T7F1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q1T7F1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q1T7F1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q1T7F1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q1T7F1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q1T7F1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q1T7F1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q1T7F1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q1T7F1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q1T7F1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q1T7F1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q1T7F1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q1T7F1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q1T7F1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q1T7F1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q1T7F1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q1T7F1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q1T7F1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q1T7F1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q1T7F1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q1T7F1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q1T7F1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q1T7F1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q1T7F1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q1T7F1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q1T7F1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q1T7F1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q1T7F1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q1T7F1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q1T7F1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q1T7F1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q1T7F1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q1T7F1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q1T7F1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q1T7F1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q1T7F1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q1T7F1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q1T7F1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q1T7F1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q1T7F1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q1T7F1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q1T7F1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q1T7F1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q1T7F1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q1T7F1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q1T7F1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q1T7F1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q1T7F1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q1T7F1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q1T7F1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q1T7F1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q1T7F1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q1T7F1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q1T7F1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q1T7F1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q1T7F1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q1T7F1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q1T7F1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q1T7F1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q1T7F1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q1T7F1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q1T7F1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q1T7F1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q1T7F1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q1T7F1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q1T7F1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q1T7F1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q1T7F1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q1T7F1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q1T7F1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q1T7F1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q1T7F1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Q1T7F1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q1T7F1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q1T7F1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q1T7F1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q1T7F1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q1T7F1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q1T7F1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q1T7F1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q1T7F1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q1T7F1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q1T7F1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q1T7F1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q1T7F1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q1T7F1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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