Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC142Q17RM4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC142Q17RM4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms