Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LONRF1Q17RB8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
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