Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRNQ16849 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
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