Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMN1Q16637 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMN1Q16637 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMN1Q16637 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SMN1Q16637 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SMN1Q16637 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMN1Q16637 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMN1Q16637 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMN1Q16637 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMN1Q16637 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMN1Q16637 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMN1Q16637 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMN1Q16637 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMN1Q16637 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMN1Q16637 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMN1Q16637 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SMN1Q16637 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMN1Q16637 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMN1Q16637 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMN1Q16637 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMN1Q16637 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMN1Q16637 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMN1Q16637 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMN1Q16637 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMN1Q16637 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMN1Q16637 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMN1Q16637 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMN1Q16637 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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