Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SSX1Q16384 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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SSX1Q16384 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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SSX1Q16384 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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