Protein–RNA interactions for Protein: Q15303

ERBB4, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB4Q15303 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ERBB4Q15303 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
ERBB4Q15303 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ERBB4Q15303 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ERBB4Q15303 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ERBB4Q15303 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ERBB4Q15303 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ERBB4Q15303 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ERBB4Q15303 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ERBB4Q15303 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ERBB4Q15303 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ERBB4Q15303 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ERBB4Q15303 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERBB4Q15303 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERBB4Q15303 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERBB4Q15303 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERBB4Q15303 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERBB4Q15303 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERBB4Q15303 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERBB4Q15303 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ERBB4Q15303 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ERBB4Q15303 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ERBB4Q15303 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ERBB4Q15303 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
ERBB4Q15303 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ERBB4Q15303 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
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