Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPRRQ15256 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRRQ15256 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
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