Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SHPRHQ149N8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SHPRHQ149N8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SHPRHQ149N8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
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