Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB39AQ14964 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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