Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFTN1Q14699 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFTN1Q14699 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFTN1Q14699 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFTN1Q14699 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
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