Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAPGEF1Q13905 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPGEF1Q13905 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
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