Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGA9Q13797 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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