Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KRR1Q13601 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.5 ms